17 Endonuklease Ensiem Voorbeeld wat jy behoort te weet


Endonukleases is ensieme wat breek DNA in kleiner fragmente deur die fosfodiesterbinding binne 'n polinukleotiedketting te splits. Kom ons kyk na 'n paar voorbeelde daarvan.

  1. RecBCD endonuklease
  2. T7 endonuklease
  3. T4 endonuklease II
  4. Bal 31 endonuklease
  5. Endonuklease I
  6. Mikrokokke nuklease
  7. Endonuklease II
  8. S1 nuklease
  9. P1-nuklease
  10. Mungboonnuklease I
  11. DNase I Ensiem (P00639)
  12. AP endonuklease
  13. BamHI 
  14. EcoRI 
  15. EcoRV 
  16. HindIII
  17. HaeIII

RecBCD endonuklease

RecBCD endonuklease is vervaardig in E. coli sel. Dit is gedeeltelik ATP-afhanklik en werk in rekombinasie en herstel. Die RecBCD ensiem voer die dubbele rolle van 'n nuklease en 'n helikase, wat die DNS-stringe afblaas of skei en enkelstrengige inkepings in die DNS genereer.

T7 endonuklease (P00641)

Faag T7 (geen 3) is die bron van T7 endonuklease ensiem. replikasie vereis DNA met 'n geneigdheid vir enkelstringe bo die dubbelstringe. 'n Ensiem wat veral aan en bind sny vierrigting (Holliday) DNA-aansluitings na virale genomiese replikasie om aansluitings op te los.

T4 endonuklease II (P07059)

Faag T4 (denA) is die bron van T4 endonuklease II. Die 5'-dCMP-einde oligonukleotiede wat deur hierdie ensiem geproduseer word, word van die -TpC- volgorde verdeel; die lengte van die produk se ketting wissel na gelang van die situasie. Hulpmiddels in die agteruitgang van gasheer DNA, wat die skepping van faag-DNS moontlik maak deur nukleotiede van die gasheer af te vang.

Bal 31 endonuklease

P. espejiana is die bron van Bal 31 endonuklease . Daarbenewens word die 3'- en 5'-punte van dupleks-DNS deur hierdie endonuklease verander. Ten minste twee nukleases, gekombineer met beide vinnige en stadige ensieme.

Endonuklease I (endo I; P25736)

E. coli (eindeA) is die bron van Endonuklease I. Endo I-mutante gaan voort om behoorlik te ontwikkel ten spyte daarvan dat hulle in die periplasma is, wat 'n gemiddelde kettinglengte van sewe vertoon, sal geïnhibeer word deur tRNA, veroorsaak dubbelstrengige DNA-addukte, en die opwekking van nicks wanneer gekomplekseer met tRNA.

Mikrokok-nuklease (P00644)             

Staphylococcus is die bron van Mikrokokke nuklease. Skep 3′-P-termini, bevoordeel enkelstring-DNA en AT-ryke streke, benodig kalsium en beïnvloed RNA. 'n Ensiem wat die 5'-fosfodiesterbindings in beide DNA en RNA disintegreer.

Endonuklease II (endo VI, exo III; P09030)

Coli (xthA) is die bron van Endonuklease II. Naby die klowingsplek is daar ook 'n 3′–>5′ eksonuklease, en die 3'-P-termini het fosfomonoesterase. Die primêre RE in E. coli is apurien-apirimidiniese endonuklease.

S1 nuklease (P24021)

Aspergillus oryzae is die bron. RNA word ook aangetas. Degradeer slegs enkelstrengige DNA en RNA; geen oënskynlike voorkeur vir basisse nie. Die eindprodukte van endonukleolitiese splitsing is 5'-fosfomononukleotied en 5'-fosfooligonukleotied.

P1-nuklease (P24289)

Penicillium citrinum is die bron. RNA word ook aangetas. Degradeer slegs enkelstrengige DNA en RNA; geen oënskynlike voorkeur vir basisse nie. Eindprodukte wat deur endonukleolitiese splitsing geproduseer word, sluit in 5'-fosfomononukleotied en 5'-fosfooligonukleotied.

Mungboonnuklease I

Mung boontjiespruite is die bron. RNA word ook aangetas. Dubbelstring DNA, DNA/RNA basters of dubbelstring RNA word egter nie deur die ensiem afgebreek nie. Dit net produseer nukleosied 5'-monofosfate wanneer enkelstrengs DNA of RNA afgebreek word.

DNase I Ensiem (P00639)

Beespankreas is die bron. Die produk het gemiddeld 'n vierskakelketting, en Mn2+ lei tot 'n dubbele draadbreuk. Serum endonuklease word deur talle vervaardig eksokrien en endokriene organe en word in liggaamsvloeistowwe aangetref.

AP endonuklease

Kern en mitochondria is die bronne. Dit behels die DNA Base Excision Repair-weg. Die DNA-BER gebruik die AP-endonuklease-ensiem (basis-eksisie-herstelweg).

BamHI

BamHI, 'n tipe II beperking endonuklease gegenereer deur Bacillus amyloliquefaciens, kan kort (6 bp) DNA-volgordes opspoor en sny hulle presies op 'n teikenplek.

EcoRI

EcoRI is 'n beperking endonuklease ensiem dit is 'n komponent van die beperkingsmodifikasiestelsel en breek DNA-dubbelhelikse af in fragmente op sekere plekke.

EcoRV 

EcoRV is 'n tipe II beperking endonuklease wat by die naam gaan Eco32 ek. Dit word wyd gebruik beperkingsensiem in molekulêre biologie.

HindIII

Die Haemophilus influenzae tipe II-plekspesifieke deoksiribonuklease-beperkingsensiem hidroliseer die kofaktor Mg2+ om die DNA palindromiese volgorde, AAGCTT, te breek.

hahaIII

hahaIII is 'n endonuklease wat organismes teen ongeïdentifiseerde, eksterne DNS beskerm. Dit word in molekulêre biologie laboratoriums gebruik. Dit was die derde endonuklease wat in die bakterieë ontdek is Haemophilus aegyptius

Gevolgtrekking

Ensieme genoem endonukleases breek die fosfodiesterbinding af wat in polinukleotiedkettings voorkom. Terwyl baie DNS-snyende ensieme by uiters spesifieke nukleotiedvolgordes klief, breek ander, soos deoksiribonuklease I, DNS ietwat willekeurig (sonder inagneming van volgorde).

Ganeshprasad DN

Hi....ek is Ganeshprasad DN, het my Ph.D. in Biochemie van die Mangalore Universiteit, is ek van plan om my kennis en tegniese vaardighede te gebruik om verder navorsing in my gekose veld na te streef. LinkedIn: linkedin.com/in/dn-ganeshprasad-157b8a107

Onlangse plasings